故事发生在距今约一百多年的一个叫做百莱达的城市。因为四十年前“某事”的缘故，地球处于濒临与毁灭的状态，同时人们也失去了在此之前的记忆。即使在丧失了过去的历史与技术这样的一个状态之中，人们仍然凭着残留的科技慢慢的一步步重新建立了社会与秩序。 然而与此同时，由过去的超文明所孕育的大魔神（Megadues）亦威胁着人们的生活。唯一能够与这些过去的亡魂抗衡并消灭它们的只有罗杰.史密斯与由他驾驶——谜一般的BIG-O！而又是谁，为了什么目的把BIG-O交托给罗杰的呢？答案大概与罗杰谈判专家的职业和BIG-O启动时出现的这句话：“我以神之名义打造，汝等无罪”“风之民”的末裔亚蒙是个具有不可思议力量的少年，但想要征服世界的布拉尼克却企图利用亚蒙的这种力量作为能源来制造大屠杀的武器——微粒子爆弹。在从布拉尼克手中逃跑时，亚蒙不慎落入深渊，这时他得到了“海之民”玛莉娅的帮助。亚蒙与玛莉娅决心一起来打倒布拉尼克，故事就从这里展开……